Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VtnP29788 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VtnP29788 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VtnP29788 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VtnP29788 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VtnP29788 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VtnP29788 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VtnP29788 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VtnP29788 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VtnP29788 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VtnP29788 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VtnP29788 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VtnP29788 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VtnP29788 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VtnP29788 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VtnP29788 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VtnP29788 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
VtnP29788 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VtnP29788 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VtnP29788 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
VtnP29788 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
VtnP29788 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VtnP29788 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VtnP29788 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VtnP29788 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VtnP29788 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VtnP29788 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VtnP29788 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VtnP29788 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VtnP29788 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VtnP29788 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VtnP29788 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VtnP29788 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VtnP29788 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VtnP29788 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VtnP29788 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VtnP29788 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VtnP29788 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VtnP29788 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VtnP29788 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VtnP29788 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VtnP29788 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
VtnP29788 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VtnP29788 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VtnP29788 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
VtnP29788 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VtnP29788 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
VtnP29788 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VtnP29788 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
VtnP29788 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
VtnP29788 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VtnP29788 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VtnP29788 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VtnP29788 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VtnP29788 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VtnP29788 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VtnP29788 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VtnP29788 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VtnP29788 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VtnP29788 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VtnP29788 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VtnP29788 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VtnP29788 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VtnP29788 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VtnP29788 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VtnP29788 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VtnP29788 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VtnP29788 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VtnP29788 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VtnP29788 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VtnP29788 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VtnP29788 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VtnP29788 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VtnP29788 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VtnP29788 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VtnP29788 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VtnP29788 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VtnP29788 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VtnP29788 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VtnP29788 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VtnP29788 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VtnP29788 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VtnP29788 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VtnP29788 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VtnP29788 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VtnP29788 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VtnP29788 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VtnP29788 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VtnP29788 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VtnP29788 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
VtnP29788 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
VtnP29788 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VtnP29788 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VtnP29788 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VtnP29788 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VtnP29788 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VtnP29788 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VtnP29788 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VtnP29788 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VtnP29788 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms