Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxraP28700 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxraP28700 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxraP28700 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RxraP28700 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxraP28700 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxraP28700 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxraP28700 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxraP28700 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxraP28700 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxraP28700 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxraP28700 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxraP28700 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxraP28700 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxraP28700 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxraP28700 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxraP28700 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxraP28700 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxraP28700 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxraP28700 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxraP28700 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxraP28700 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxraP28700 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxraP28700 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RxraP28700 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxraP28700 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxraP28700 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxraP28700 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxraP28700 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxraP28700 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxraP28700 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxraP28700 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxraP28700 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxraP28700 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxraP28700 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxraP28700 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxraP28700 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RxraP28700 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxraP28700 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxraP28700 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxraP28700 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxraP28700 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxraP28700 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxraP28700 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxraP28700 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxraP28700 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxraP28700 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxraP28700 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxraP28700 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxraP28700 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxraP28700 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxraP28700 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxraP28700 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxraP28700 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxraP28700 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxraP28700 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxraP28700 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxraP28700 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxraP28700 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxraP28700 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxraP28700 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RxraP28700 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxraP28700 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxraP28700 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxraP28700 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxraP28700 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxraP28700 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxraP28700 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxraP28700 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxraP28700 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxraP28700 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxraP28700 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxraP28700 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxraP28700 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxraP28700 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxraP28700 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxraP28700 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RxraP28700 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxraP28700 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxraP28700 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RxraP28700 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxraP28700 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxraP28700 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RxraP28700 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxraP28700 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxraP28700 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxraP28700 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxraP28700 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxraP28700 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxraP28700 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxraP28700 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxraP28700 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RxraP28700 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxraP28700 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxraP28700 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxraP28700 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxraP28700 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxraP28700 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxraP28700 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RxraP28700 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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