Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

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Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Tgfb2P27090 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfb2P27090 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms