Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NdnP25233 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
NdnP25233 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NdnP25233 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NdnP25233 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NdnP25233 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NdnP25233 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NdnP25233 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NdnP25233 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NdnP25233 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
NdnP25233 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NdnP25233 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NdnP25233 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NdnP25233 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NdnP25233 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NdnP25233 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NdnP25233 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
NdnP25233 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NdnP25233 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NdnP25233 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NdnP25233 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
NdnP25233 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
NdnP25233 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NdnP25233 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NdnP25233 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NdnP25233 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NdnP25233 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NdnP25233 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NdnP25233 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NdnP25233 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NdnP25233 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NdnP25233 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NdnP25233 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
NdnP25233 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NdnP25233 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NdnP25233 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
NdnP25233 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
NdnP25233 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
NdnP25233 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
NdnP25233 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NdnP25233 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NdnP25233 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NdnP25233 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NdnP25233 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NdnP25233 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NdnP25233 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NdnP25233 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NdnP25233 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NdnP25233 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NdnP25233 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NdnP25233 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NdnP25233 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NdnP25233 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NdnP25233 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NdnP25233 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NdnP25233 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NdnP25233 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NdnP25233 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
NdnP25233 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
NdnP25233 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NdnP25233 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NdnP25233 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms