Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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