Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.3 ms