Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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PdgfaP20033 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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