Protein–RNA interactions for Protein: P17225

Ptbp1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptbp1P17225 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ptbp1P17225 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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