Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms