Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Becn2P0DM65 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms