Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb3P09026 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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