Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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PdgfrbP05622 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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PdgfrbP05622 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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PdgfrbP05622 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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