Protein–RNA interactions for Protein: P01820

Ig heavy chain V region PJ14, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01820 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01820 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P01820 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01820 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01820 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01820 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01820 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01820 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P01820 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01820 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01820 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P01820 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01820 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01820 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01820 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01820 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01820 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01820 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01820 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01820 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01820 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01820 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01820 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01820 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01820 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01820 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01820 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01820 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01820 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01820 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01820 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01820 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01820 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01820 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01820 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01820 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01820 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01820 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01820 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01820 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01820 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01820 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01820 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01820 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01820 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01820 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01820 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01820 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01820 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01820 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01820 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01820 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01820 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01820 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01820 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01820 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01820 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01820 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01820 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01820 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01820 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
P01820 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01820 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01820 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01820 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01820 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01820 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01820 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01820 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01820 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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