Protein–RNA interactions for Protein: P01748

Ig heavy chain V region 23, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01748 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P01748 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P01748 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P01748 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P01748 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P01748 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P01748 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P01748 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P01748 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P01748 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P01748 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P01748 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P01748 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P01748 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P01748 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P01748 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P01748 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P01748 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P01748 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P01748 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P01748 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P01748 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P01748 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P01748 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P01748 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01748 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01748 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01748 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P01748 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01748 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01748 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01748 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01748 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01748 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01748 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01748 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01748 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01748 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01748 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01748 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01748 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01748 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01748 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01748 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01748 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01748 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P01748 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01748 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01748 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01748 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01748 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01748 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01748 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01748 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01748 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01748 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01748 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01748 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01748 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01748 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01748 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01748 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01748 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01748 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01748 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01748 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01748 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01748 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01748 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01748 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01748 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01748 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P01748 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01748 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01748 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01748 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01748 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01748 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01748 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01748 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01748 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01748 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01748 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01748 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01748 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01748 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01748 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01748 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01748 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01748 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01748 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01748 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01748 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01748 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01748 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01748 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01748 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01748 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01748 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01748 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms