Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops6O88545 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops6O88545 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops6O88545 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops6O88545 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops6O88545 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops6O88545 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops6O88545 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms