Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms