Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms