Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms