Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChkaO54804 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChkaO54804 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChkaO54804 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChkaO54804 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChkaO54804 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ChkaO54804 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChkaO54804 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChkaO54804 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms