Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffaO54786 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffaO54786 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffaO54786 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffaO54786 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffaO54786 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffaO54786 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffaO54786 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffaO54786 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffaO54786 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffaO54786 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
DffaO54786 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
DffaO54786 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffaO54786 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffaO54786 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffaO54786 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
DffaO54786 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffaO54786 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
DffaO54786 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffaO54786 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffaO54786 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffaO54786 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffaO54786 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffaO54786 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffaO54786 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffaO54786 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffaO54786 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffaO54786 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffaO54786 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffaO54786 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffaO54786 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffaO54786 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffaO54786 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffaO54786 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffaO54786 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffaO54786 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DffaO54786 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DffaO54786 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DffaO54786 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DffaO54786 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DffaO54786 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DffaO54786 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DffaO54786 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DffaO54786 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DffaO54786 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DffaO54786 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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DffaO54786 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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DffaO54786 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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DffaO54786 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DffaO54786 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DffaO54786 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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DffaO54786 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DffaO54786 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DffaO54786 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DffaO54786 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DffaO54786 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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DffaO54786 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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DffaO54786 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DffaO54786 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DffaO54786 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DffaO54786 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DffaO54786 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DffaO54786 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DffaO54786 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DffaO54786 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DffaO54786 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DffaO54786 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DffaO54786 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DffaO54786 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DffaO54786 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DffaO54786 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DffaO54786 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DffaO54786 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DffaO54786 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
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DffaO54786 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DffaO54786 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
DffaO54786 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DffaO54786 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DffaO54786 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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