Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sp100O35892 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Sp100O35892 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Sp100O35892 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sp100O35892 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Sp100O35892 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sp100O35892 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sp100O35892 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Sp100O35892 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sp100O35892 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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