Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms