Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms