Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms