Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21976J3QNN2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms