Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms