Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp17lcG5E8I7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms