Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf148G3X9R7 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms