Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp72F8VQC1 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp72F8VQC1 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp72F8VQC1 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp72F8VQC1 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp72F8VQC1 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp72F8VQC1 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp72F8VQC1 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp72F8VQC1 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp72F8VQC1 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp72F8VQC1 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp72F8VQC1 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp72F8VQC1 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp72F8VQC1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp72F8VQC1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp72F8VQC1 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp72F8VQC1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp72F8VQC1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp72F8VQC1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp72F8VQC1 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp72F8VQC1 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp72F8VQC1 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp72F8VQC1 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp72F8VQC1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp72F8VQC1 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp72F8VQC1 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp72F8VQC1 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp72F8VQC1 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp72F8VQC1 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp72F8VQC1 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp72F8VQC1 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp72F8VQC1 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp72F8VQC1 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms