Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms