Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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Gm8247F6VRJ8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8247F6VRJ8 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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