Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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