Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms