Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Rdh16f1E9Q9P8 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Rdh16f1E9Q9P8 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Rdh16f1E9Q9P8 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Rdh16f1E9Q9P8 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rdh16f1E9Q9P8 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rdh16f1E9Q9P8 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rdh16f1E9Q9P8 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms