Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E4

Hectd4, HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, mousemouse

Predictions only

Length 4,418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd4E9Q2E4 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hectd4E9Q2E4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms