Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms