Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cttnbp2B9EJA2 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 189.1 ms