Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms