Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms