Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms