Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf3B2RQG2 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms