Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms