Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uhrf1bp1B2KF50 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms