Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprsB0V2N1 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms