Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Tmem238A9JSM3 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC9.59□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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