Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Ttll11A4Q9F4 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll11A4Q9F4 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttll11A4Q9F4 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttll11A4Q9F4 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttll11A4Q9F4 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttll11A4Q9F4 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttll11A4Q9F4 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttll11A4Q9F4 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttll11A4Q9F4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttll11A4Q9F4 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttll11A4Q9F4 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttll11A4Q9F4 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttll11A4Q9F4 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttll11A4Q9F4 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttll11A4Q9F4 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttll11A4Q9F4 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttll11A4Q9F4 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttll11A4Q9F4 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttll11A4Q9F4 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttll11A4Q9F4 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttll11A4Q9F4 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttll11A4Q9F4 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttll11A4Q9F4 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttll11A4Q9F4 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttll11A4Q9F4 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttll11A4Q9F4 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttll11A4Q9F4 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttll11A4Q9F4 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttll11A4Q9F4 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttll11A4Q9F4 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttll11A4Q9F4 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttll11A4Q9F4 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttll11A4Q9F4 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttll11A4Q9F4 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttll11A4Q9F4 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttll11A4Q9F4 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms