Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttll9A2APC3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttll9A2APC3 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttll9A2APC3 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttll9A2APC3 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttll9A2APC3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttll9A2APC3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttll9A2APC3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ttll9A2APC3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttll9A2APC3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttll9A2APC3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttll9A2APC3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttll9A2APC3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttll9A2APC3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttll9A2APC3 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttll9A2APC3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttll9A2APC3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttll9A2APC3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ttll9A2APC3 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ttll9A2APC3 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ttll9A2APC3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ttll9A2APC3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttll9A2APC3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms