Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syndig1A2ANU3 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms