Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GabreA2AMW3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms