Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramel3A2AHA7 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramel3A2AHA7 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramel3A2AHA7 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramel3A2AHA7 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramel3A2AHA7 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramel3A2AHA7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramel3A2AHA7 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramel3A2AHA7 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramel3A2AHA7 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramel3A2AHA7 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramel3A2AHA7 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramel3A2AHA7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramel3A2AHA7 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramel3A2AHA7 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramel3A2AHA7 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramel3A2AHA7 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramel3A2AHA7 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramel3A2AHA7 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramel3A2AHA7 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramel3A2AHA7 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramel3A2AHA7 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramel3A2AHA7 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramel3A2AHA7 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramel3A2AHA7 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramel3A2AHA7 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramel3A2AHA7 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramel3A2AHA7 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramel3A2AHA7 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramel3A2AHA7 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramel3A2AHA7 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramel3A2AHA7 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramel3A2AHA7 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramel3A2AHA7 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramel3A2AHA7 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramel3A2AHA7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramel3A2AHA7 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramel3A2AHA7 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramel3A2AHA7 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramel3A2AHA7 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms